14 години са минали след последния сблъсък. Светът изцяло се е променил, единственият, който си е останал същият е Шинджи, който цялото това време е прекарал в сън и сега се събужда заобиколен от съвсем нова среда. За да спаси света, той ще трябва да се изправи срещу Мисато и неговата банда. Въпреки че се чувства чужд на този свят, Шинджи е готов да се жертва, за да спаси човечеството. Филмът е с номинация за най-добър анимационен филм от Японската филмова академия, както и с номинация за най-добър филм от фестивала в Ситжес.