Альтернативний світ 2029 року – світ, у якому співіснують люди й високотехнологічні кіборги, здатні напряму взаємодіяти з Мережею. Головний персонаж фільму — майор Дев’ятого відділу Кусанаґі Мотоко, — кіборг з людським розумом усередині кібернетичного тіла. Основне завдання відділу — спіймати оголошеного в міжнародний розшук невловимого хакера, який через велику кількість жертв його діяльності та мимовільних посібників злочинів отримав прізвисько «Лялькар». Згодом виявляється, що насправді все не так, як здається на перший погляд… Цей фільм — трохи оновлена версія стрічки 1995 року.