Keď sa Scooby-Doo a jeho partia pokúsia chytiť vírus Fantóma, nešťastnou náhodou sú vtiahnutí do počítačovej hry, ktorá je založená na ich vlastných dobrodružstvách. Zatiaľ čo prenasledujú zlý vírus, musia prejsť úskaliami všetkých desiatich náročných úrovní hry, cestujú časom od prehistorických dôb až do ďalekej budúcnosti, kde sa dokonca stretávajú so strašidlami z ich najslávnejších prípadov.