Wszystko zaczęło się, kiedy kilka statków zniknęło w tajemniczych okolicznościach. Marynarze zaczęli opowiadać o strasznym potworze, który czai się na pełnym morzu. Willy Fog postanawia zanurkować w błękitny odmęt i rozwiązać tę tajemnicę. Nasz bohater i jego wierni przyjaciele mają twardy orzech do zgryzienia, przemierzając rafy koralowe i walcząc z morskimi potworami, by w końcu stać się więźniami tajemniczego Kapitana Nemo na pokładzie jego nadzwyczajnej łodzi podwodnej Nautilus.