Doctor Vlimmen is het verhaal van een plattelandsdokter in de jaren voor de Tweede Wereldoorlog, en begint op het moment dat hij zijn vriend Dacka, een advocaat, van het station heeft gehaald en onderweg een aanrijding krijght met een Sint Bernard hond, eigendom van een mooie vrouw, Tilly, en haar mooie dochter Maartje. Het verhaal gaat dan 10 jaar terug. De vrouw van Vlimmen heeft hem verlaten en zijn zuster Truus zorgt voor het huishouden. Regelmatig ontvlucht hij samen met Dacka de bekrompen gemeenschap om eventjes de bloemetjes buiten te zetten.