2112; de zomer voordat Akane Tsunemori werd toegewezen aan Divisie Eén van de afdeling Recherche van het Openbaar Veiligheidsbureau. Teppei Sugo, een ervaren piloot van de 15e Integrated Task Force van het Defensieleger, sluit zich aan bij de militaire operatie in Okinawa. Drie maanden later opent een onbemande gevechtsdrone het vuur op het Ministerie van Defensie in Tokio. Handhaver Tomomi Masaoka van CID Division One wordt naar de militaire basis van Sugo gestuurd om de waarheid achter deze zaak te onderzoeken.