Scooby-Doo en zijn vrienden Shaggy, Daphne, Fred en Velma moeten het opnemen tegen één van hun engste en meest mysterieuze tegenstanders ooit. Deze keer blijven ze niet met hun benen op de grond staan, maar reizen ze af naar de maan. De vrienden winnen vijf tickets voor een ruimtereis naar de maan, die ze samen met miljardair Sly Baron gaan maken.