Het jaar is 2030 en zes jaar zijn verstreken sinds een crimineel die alleen bekend staat als 'The Laughing Man' de top van de medische nanotechnologiebedrijven binnendrong en daden van cyberterrorisme, ontvoering en spionage pleegde, waardoor er geen bekende verdachten achterbleven. Nieuwe informatie wordt onthuld nu Section 9 op jacht gaat naar een verdachte die in staat is tot ondoorgrondelijke acties in deze compilatie van Stand Alone Complex-content.