Onmiddellijk na het winnen van de Nationale Kampioenschappen wordt Tyson uitgedaagd door een mysterieuze jongen genaamd Daichi, die vastbesloten is de volgende Beyblading-kampioen te worden. Maar wanneer ze vechten, wekken hun Beyblades oude duistere krachten op die een menselijke vorm aannemen en de kwaadaardige Shadow-Bladers worden die beloven de mensheid te vernietigen! Nu is het aan Tyson en de Bladebreakers om de Shadow-Bladers te verslaan voordat ze hun vernietigende plan uitvoeren. Zullen ze slagen... of is dit het einde van de Bladebreakers?