De bende van Mystery Inc. maakt een reis naar Japan en bevindt zich in Azië en de Stille Oceaan tijdens een schattenjacht, terwijl ze racen tegen de wraakzuchtige Black Samurai en zijn Ninja-krijgers om het legendarische Sword of Fate te vinden, een eeuwenoud mes dat buitengewone bovennatuurlijke krachten zou bezitten.