12-årige Otis arbejder som succesfuld tv-skuespiller i Hollywood. Når Otis ikke arbejder, bor han på et motel i udkanten af byen sammen med sin anmassende og voldelige ex-rodeo klovnefar. Honey Boy følger to tidsperioder, hvor man følger et omstridt far-søn forhold og forsøget på at reparere det over 10 år.