Японските острови, 20 години в бъдещето. Кучешката популация е нараснала лавинообразно и в Мегасаки избухва епидемия от кучешки грип. По спешна заповед на кмета Кобаяши е наложена карантина и всички кучета са прокудени на отделен остров, който се превръща в кучешка колония. Шест месеца по-късно миниатюрен едномоторен самолет се разбива на гъмжащия от четириноги пуст остров. Глутница от пет изгладнели, но смели изоставени кучета хуква към горящите отломки и отрива замаяния 12-годишния пилот – сирачето Атари, за което се грижи кметът Кобаяши. С помощта на новите си приятели Атари започва да търси кучето си и разкрива конспирация, която заплашва да унищожи всички кучета в Мегасаки завинаги.