Когато преди шест години Алф бе напът да си отиде удома, той бе заловен от отдела за борба с извънземните. Историята продължава с неговите неволи зад решетките и един полковник, твърдо решен да го елиминира. На помощ му се притичват майор Хил и капитан Молигън, които го отвличат от военната база и го отвеждат при бивш служител на НАСА. Той цял живот е искал да докаже на хората, че извънземните съществуват и е готов на всичко, за да разкрие Алф пред света. До какво ще доведат пагубните стремежи на полковника и материалните интересни на учения ще узнаем само от финалния филм за Алф.