사일런들의 카프리카 침공 10개월 전. 1호 존 카빌은 인류를 멸망시키기 위한 전쟁 준비를 차근 차근 준비 중이다. 자신의 부모격인 사일런... 마지막 5인을 기억을 지운채 인간 사회로 보낸 1호는 이번 전쟁을 통해 그들이 자기가 옳았음을 인정하길 바란다. 그리고 1호 중 한 개체는 (이하 콜로니 1호) 인류의 멸망 과정을 직접 체험하고 싶다며 마지막 5인 중 자신이 집착하는 엘렌 타이 곁으로 향하는데...